När O-antigenpolymeren är ansluten till kärnan av lipid A, kommer den att stoppa polymerisationsreaktionen. Det vill säga att kopplingsreaktionen kan avsluta polymerisationsreaktionen. Både kärnan av lipid A och lipopolysackariden med olika längd upprepade enheter kan effektivt överföras till det yttre membranet. Därför kan molekylstorleken för lipopolysackarid ses av SDS-PAGE, som orsakas av skillnaden i biosyntessystemet snarare än faktorn för utmatningssystemet.
Fördelningen av sidokedjan av O-antigen i olika bakterier är olika, av vilka några innehåller cirka 20 upprepade enheter och några av dem kan vara cirka 100 upprepade enheter. I SDS-PAGE-elektrofores återspeglas skillnaden i silverfärgningsintensitet för olika molekyler av olika bakteriearter. Orsaken till den olika fördelningen av sidokedjelängden av O-antigen i olika bakterier kan vara att det finns en storleksselektionsfaktor i processen för O-antigenpolykondensation eller kopplingsreaktion. Wzz (dvs. Rol eller Cld) är ett viktigt protein som reglerar fördelningen av sidokedjelängden i bakterier som syntetiserar antigener via Wzy-beroende väg, men dess specifika mekanism är fortfarande oklar.